Las buenas relaciones entre plantas se manifiestan de varias maneras. Los efectos protectores (contra enfermedades) o repelentes (contra insectos) son, sin duda, los más importantes. A veces las plantas se ayudan entre sí, protegiéndose las unas de las otras del ataque de enfermedades o parásitos propias de una de ellas. Los puerros y las zanahorias son un ejemplo muy claro: el olor a puerro repele a la mosca de la zanahoria, mientras que la zanahoria ahuyenta a la polilla del puerro.
Otras plantas excretan sustancias que protegen a otras plantas ubicadas en las cercanías. Es habitual cultivar tagetes o claveles de la India en el huerto, ya que las secreciones de su raíz protegen a otros vegetales del ataque de los nematodos.
La combinación de las plantas también permite un mayor aprovechamiento del suelo, alternando vegetales con raíces poco profundas y vegetales con raíces profundas (por ejemplo, maíz y calabaza).
